新的PCR引物数据库 以对抗RNA病毒流行病 由大邱庆北科技学院提供

韩国大邱庆北科学技术研究所(DGIST)科学家的科学家编制了一个全面的新的遗传信息公共数据库，以便使用聚合酶链反应(PCR)检测RNA病毒的检测和鉴定。该数据库在对抗潜在的未来流行病方面应该具有无可估量的价值。

含有核糖核酸作为遗传物质的RNA病毒会引起许多传染病，包括流感，脊髓灰质炎和麻疹。近年来，出现了由RNA病毒引起的新的和致命的疾病，特别是严重的急性呼吸综合症(SARS)和中东呼吸道疾病(MERS)，这两者都具有严重的健康和经济影响。

2002年中国南方出现了SARS疫情。在最终控制之前，37个国家的774人死亡，而去年在韩国的MERS爆发导致外国旅游减少了40%，对国民经济产生了不利影响。

在这两种情况下，由于对负责任病毒的诊断缓慢且不可靠，疾病迅速蔓延。当发生此类疾病暴发时，准确的病原体检测和鉴定至关重要，以便了解和控制疾病，从而最大限度地减少其对公众健康的影响。

PCR涉及扩增DNA的一部分以产生数千或数百万拷贝的特定DNA序列，由于其低成本但高灵敏度和特异性，被广泛用于快速和准确的病毒鉴定。

PCR使用“热循环”，其需要反复加热和冷却反应以进行DNA融化和酶促(聚合酶)DNA复制。包含短链DNA的引物，通常长18-22个核苷酸碱基，作为DNA合成的起始点，酶DNA聚合酶能够进行选择性重复扩增。

然而，很少有在线数据库编制了用于RNA病毒的高质量PCR引物，并且可用的那些具有限制其有用性的某些限制。

为了满足这一需求，由DG的Min-Soo Kim(信息与通信工程系)和JaeHyung Koo(脑与认知科学系)领导的研究小组编制了一个全面的PCR引物新数据库，以便进行检测。更快速有效地鉴定RNA病毒。他们在2016年11月29日的核酸研究中报告了他们的结果。

新的DGIST参考资源，MTPrimerV数据库，包含152,380,247个PCR引物对，用于检测1,818种病毒，包括7,144种基因编码序列或CDS(来自编码DNA序列)，它们是基因DNA的一部分或编码蛋白质的RNA。

这些计算机模拟引物能够检测最新的美国国家生物技术信息参考序列中心(NCBI RefSeq)数据库中包含的100%RNA病毒，该数据库是DNA和RNA核苷酸序列及其蛋白质产物的开放获取策划集合。

由于针对所有人类和病毒序列的严格相似性测试，MRPrimerV数据库(MRPrimerV.com)中包含的每个引物都是针对特定目标的。

“我们相信，MRPrimerV的公众可用性将促进病毒宏基因组研究，旨在评估病毒的变异性以及其他科学任务，促进对潜在流行病的有效应对，”DGIST研究人员总结道。